257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0101 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  91.89 
 
 		 37 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  89.19 
 
 		 37 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  89.19 
 
 		 37 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  83.78 
 
 		 37 aa  62  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  81.08 
 
 		 37 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 41 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 41 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2943  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.702617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2658  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4483  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000000809318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0165  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000041135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1114  LSU ribosomal protein L36P  78.38 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323838  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0134  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000370464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0606  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0128  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000290625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0147  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.12263e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5171  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000396935  unclonable  4.5390900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0129  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000256453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0155  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000628641  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1394  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 43 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20630  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0927005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2629  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3879  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0289  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  4.62447e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0960  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0239  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36558  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16930  LSU ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29490  LSU ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5149  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.982294  normal  0.58314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4294  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6587  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0651  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 46 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1168  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0589  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0310  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.696988  normal  0.327601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0712  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0510  50S ribosomal protein L36  72.22 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>