251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0498 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  62.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 41 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 48 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  75.68 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0252  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0179  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 41 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4035  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000035995  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0220  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000362841  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0215  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000134125  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0217  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000098301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0220  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000946708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3738  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000224875  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4149  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0169  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000409443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4669  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000672096  unclonable  0.00000000651208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1363  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0234  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000243083  unclonable  0.00000771527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5049  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000992018  hitchhiker  0.0000000744799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1500  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0422  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4255  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277487  unclonable  0.00000000000170252 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1394  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf415  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0349  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3724  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0783  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000359865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19750  LSU ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00973843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2808  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  hitchhiker  0.0000000195432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3971  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 43 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2928  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>