246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3305 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3305  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0956  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 37 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  91.89 
 
 		 37 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  0.00000401292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  89.19 
 
 		 37 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000684767  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000373745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0191  ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000986324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  75.68 
 
 		 41 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080a  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000400492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000225133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0179  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000187157  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0252  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4035  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000035995  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0220  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000362841  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0215  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000134125  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3738  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000224875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0220  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000946708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0217  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000098301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4149  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0622  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0139923  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0101  50S ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0169  50S ribosomal protein L36  81.08 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000409443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000250249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4669  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000672096  unclonable  0.00000000651208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0234  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000243083  unclonable  0.00000771527 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000298686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0498  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000794474  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0475  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0323  50S ribosomal protein L36  78.38 
 
 		 37 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2610  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142007  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3503  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000992018  hitchhiker  0.0000000744799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000518993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0446  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250661  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0350  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0325149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0520  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.130512  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4221  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 43 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2254  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.031997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3927  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1394  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2295  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0497  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2303  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.494369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2043  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000133507  hitchhiker  0.000165902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0341  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.165247  hitchhiker  0.000355537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000239291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3316  50S ribosomal protein L36  64.86 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.696898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0891  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0442  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 41 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4255  50S ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277487  unclonable  0.00000000000170252 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0337  ribosomal protein L36  75.68 
 
 		 37 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0479  50S ribosomal protein L36P  72.97 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1808  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2687  ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00180779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3421  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 37 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.193423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2689  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2374  50S ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2351  ribosomal protein L36  67.57 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000678722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  67.57 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0131  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0135  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000544663  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3971  ribosomal protein L36  72.97 
 
 		 37 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0341  50S ribosomal protein L36P  62.16 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000597452  unclonable  0.0000000332549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2621  50S ribosomal protein L36P  62.16 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.775374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  70.27 
 
 		 37 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>