151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1169 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  92.11 
 
 		 38 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  89.47 
 
 		 38 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  86.84 
 
 		 38 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  81.58 
 
 		 38 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  78.95 
 
 		 38 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  71.05 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1109  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  65.85 
 
 		 42 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 42 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12261  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1540  ribosomal protein L36  67.65 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000114042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  60.53 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2467  50S ribosomal protein L36P  60.98 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1316  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000142066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1370  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 41 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36460  LSU ribosomal protein L36P  60 
 
 		 40 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0284  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 40 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30024  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1828  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  56.1 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0312  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1114  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279112  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1686  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 39 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2273  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158298  hitchhiker  0.00291213 
 
 
-
 
NC_004310  BR1746  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  62.16 
 
 		 38 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0873  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2041  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658877  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2400  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000387542  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  57.89 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2674  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 41 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0162  ribosomal protein L36  55 
 
 		 40 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2206  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000124875  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  57.89 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3258  50S ribosomal protein L36P  56.1 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.665984  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  55 
 
 		 41 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3651  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 49 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128115  normal  0.260738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1270  ribosomal protein L36  59.38 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0125  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  43.9  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  52.63 
 
 		 39 aa  43.5  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000046769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00258  hypothetical protein  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3309  ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3997  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23231  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0935  50S ribosomal protein L36  63.64 
 
 		 46 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.736932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0341  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000793538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  60 
 
 		 40 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1162  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145862  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1167  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0349  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0306  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0387  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3324  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0323  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 46 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000213214  normal  0.0994232 
 
 
-
 
NC_002620  TC0169  50S ribosomal protein L36  61.54 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0057232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17710  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000404363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1541  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1124  ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202037  unclonable  0.0000000081945 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4677  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0520  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  55.26 
 
 		 37 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0573  50S ribosomal protein L36  60.61 
 
 		 46 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000869991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0066  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.453631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2806  50S ribosomal protein L36  57.58 
 
 		 41 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.551132  normal  0.645495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>