74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0284 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0284  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 40 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30024  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0162  ribosomal protein L36  85 
 
 		 40 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36460  LSU ribosomal protein L36P  85 
 
 		 40 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  70 
 
 		 40 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3254  50S ribosomal protein L36  65 
 
 		 40 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3409  ribosomal protein L36  65 
 
 		 40 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  62.5 
 
 		 38 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3115  50S ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2998  50S ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 41 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  60 
 
 		 38 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 42 aa  47.8  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1270  ribosomal protein L36  62.5 
 
 		 41 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  58.54 
 
 		 41 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  60 
 
 		 41 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 42 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 41 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  60 
 
 		 38 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0873  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2674  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0205  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2467  50S ribosomal protein L36P  56.1 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3258  50S ribosomal protein L36P  56.1 
 
 		 41 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.665984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3273  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 41 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0387  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 41 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1686  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  55 
 
 		 38 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00889  50S ribosomal protein L36  60 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0343443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1746  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1644  50S ribosomal protein L36  60 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2025  ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387216  normal  0.750795 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1540  ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000114042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1599  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1167  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5959  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12261  50S ribosomal protein L36  52.5 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  55 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0085  ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1288  50S ribosomal protein L36  55 
 
 		 41 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  hitchhiker  0.0037053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  55 
 
 		 38 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3997  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.465772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0983  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  50 
 
 		 107 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3651  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 49 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128115  normal  0.260738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5210  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10421  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1786  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1214  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0342  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 42 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2968  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387293  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1398  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3989  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.342507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3032  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000460301  normal  0.141491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0066  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.453631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2806  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.551132  normal  0.645495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2863  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3070  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2983300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0131  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.609052  normal  0.221368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3211  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000339117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2741  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.759757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1398  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0125  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3050  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 47 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00253924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1542  50S ribosomal protein L36  55 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1109  50S ribosomal protein L36  52.5 
 
 		 38 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1656  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1418  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>