38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0162 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0162  ribosomal protein L36  100 
 
 
40 aa  80.9  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0284  50S ribosomal protein L36  85 
 
 
40 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30024  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36460  LSU ribosomal protein L36P  85 
 
 
40 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  70 
 
 
40 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3254  50S ribosomal protein L36  70 
 
 
40 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3409  ribosomal protein L36  67.5 
 
 
40 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  65.85 
 
 
41 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  65.85 
 
 
41 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  57.5 
 
 
38 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2467  50S ribosomal protein L36P  60.98 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  63.41 
 
 
41 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 
42 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 
42 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  57.5 
 
 
38 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  55 
 
 
38 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2998  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 
41 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3115  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 
41 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  55 
 
 
38 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  58.54 
 
 
41 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3258  50S ribosomal protein L36P  53.66 
 
 
41 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.665984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1288  50S ribosomal protein L36  60 
 
 
41 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  hitchhiker  0.0037053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0873  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
41 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160816  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 
41 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
41 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  55 
 
 
38 aa  42  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
41 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2674  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
41 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  53.66 
 
 
41 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1270  ribosomal protein L36  57.5 
 
 
41 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  52.5 
 
 
38 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  60.98 
 
 
41 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  55 
 
 
38 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  52.5 
 
 
38 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0342  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
42 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00889  50S ribosomal protein L36  60 
 
 
41 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0343443  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0205  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 
41 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1644  50S ribosomal protein L36  60 
 
 
41 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3273  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 
41 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>