101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1109 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1109  50S ribosomal protein L36  100 
 
 		 38 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12261  50S ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 38 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0865  ribosomal protein L36  84.21 
 
 		 38 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234979  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1915  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05830  ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0375  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 		 38 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0625  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4366  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879535  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1169  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 		 38 aa  50.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.406968  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  68.42 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1638  ribosomal protein L36  65.79 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5764  ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 38 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28632  predicted protein  52.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0071  50S ribosomal protein L36  65 
 
 		 40 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.484433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 38 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3409  ribosomal protein L36  65 
 
 		 40 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3254  50S ribosomal protein L36  62.5 
 
 		 40 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28444  mitochondrial ribosomal L36 protein  57.89 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0515598  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0055  ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 41 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3630  ribosomal protein L36  63.41 
 
 		 41 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1004  50S ribosomal protein L36  63.16 
 
 		 37 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000566406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2527  50S ribosomal protein L36P  58.54 
 
 		 41 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1746  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1686  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0766  ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10477  hypothetical protein  52.63 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 39 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000282576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0977  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.403933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1167  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2741  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.759757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0131  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.609052  normal  0.221368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5210  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10421  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2863  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1786  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2968  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387293  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5959  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3686  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2883  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194486  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  60.53 
 
 		 37 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2551  50S ribosomal protein L36  56.1 
 
 		 41 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3276  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476981  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36460  LSU ribosomal protein L36P  57.5 
 
 		 40 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1858  ribosomal protein L36  59.46 
 
 		 38 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0997055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3258  50S ribosomal protein L36P  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.665984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000431262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0712  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3273  50S ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3575  50S ribosomal protein L36  48.78 
 
 		 41 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000948568  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2595  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0561863  normal  0.639398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0169  50S ribosomal protein L36  58.97 
 
 		 45 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0057232  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0384  50S ribosomal protein L36  60.98 
 
 		 42 aa  40.8  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.798152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 37 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1214  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0284  50S ribosomal protein L36  52.5 
 
 		 40 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30024  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0085  ribosomal protein L36  51.22 
 
 		 41 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1421  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  57.89 
 
 		 37 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01410  LSU ribosomal protein L36P  55.26 
 
 		 37 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0615233  normal  0.988517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0110  ribosomal protein L36  57.5 
 
 		 41 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.101674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  57.89 
 
 		 37 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000807899  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3651  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128115  normal  0.260738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  50 
 
 		 38 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000033684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0983  50S ribosomal protein L36  53.66 
 
 		 41 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0656  50S ribosomal protein L36  58.54 
 
 		 42 aa  40  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.98092  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000232904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000525761  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000229696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000552081  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000900319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  55.26 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000265715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  52.63 
 
 		 38 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0205  50S ribosomal protein L36  46.34 
 
 		 41 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>