More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2966 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2966  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0128316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  52.22 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  51.72 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1956  nucleoid protein Hbs  50.57 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.582961  normal  0.45981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  48.28 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  50.57 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  47.87 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  48.89 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  49.44 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  46.81 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1666  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  46.81 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  90.1  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  46.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  48.89 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1789  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  46.81 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3065  nucleoid protein Hbs  47.13 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135138  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  46.67 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  45.56 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.78 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  48.31 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  47.13 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  48.28 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  49.43 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  48.28 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  46.67 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2697  histone family protein DNA-binding protein  45.98 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1714  DNA-binding protein HU-beta  45.98 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.606946  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  47.78 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  46.07 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>