136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2068 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2068  IS630 family transposase  100 
 
 
183 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0017  transposase ISY100e  45.34 
 
 
185 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  30.51 
 
 
282 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0049  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.155938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0325  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0702  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0860  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.661529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0876  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0958  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.569395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1289  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1794  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.401882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2052  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.429798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3025  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.05528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0071  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0385  IS630 family transposase  35.82 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1338  hypothetical protein  30.34 
 
 
280 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0658  IS630 family transposase  36.45 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2873  IS630 family transposase  36.45 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2258  hypothetical protein  32.84 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1045  putative transposase  33.33 
 
 
118 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.847171  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  27.71 
 
 
318 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  27.71 
 
 
318 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1283  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0782139  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3769  IS630 family transposase  32.18 
 
 
134 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  27.5 
 
 
283 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  28.14 
 
 
317 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  28.14 
 
 
317 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0074  putative transposase  35.87 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2298  hypothetical protein  29.89 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2854  hypothetical protein  29.89 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3055  hypothetical protein  29.89 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0585926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0633  hypothetical protein  33.65 
 
 
148 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.593372  normal  0.168007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1331  helix-turn-helix, Fis-type  58.97 
 
 
103 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.221514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1615  transposase  60 
 
 
103 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.73 
 
 
318 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  28.45 
 
 
238 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.22 
 
 
315 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  40.32 
 
 
68 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4477  ISSpo6, transposase OrfB  29.09 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.845836  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4537  ISSpo6, transposase OrfB  29.09 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1882  putative transposase  33.68 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  35.09 
 
 
59 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  28.14 
 
 
315 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  29.75 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  29.75 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  28.93 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  28.93 
 
 
213 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  28.93 
 
 
213 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  28.93 
 
 
213 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  35.24 
 
 
314 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  27.42 
 
 
319 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  35.24 
 
 
314 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  29.75 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  29.75 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  28.93 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  28.93 
 
 
213 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  27.4 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  39.29 
 
 
158 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  29.23 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  27.62 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  26.67 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  26.67 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>