33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1415 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  760    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  38.43 
 
 
349 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  43.5 
 
 
349 aa  149  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  30.43 
 
 
348 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  40.35 
 
 
378 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  35.89 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  36.1 
 
 
378 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  32.1 
 
 
397 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  37.38 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  30.89 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  40.11 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  31.89 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  40.44 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  34.41 
 
 
375 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  33.18 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  35.18 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  43.05 
 
 
374 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  36.25 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  36.08 
 
 
330 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  36.27 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  34.72 
 
 
355 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  43.36 
 
 
377 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  31.01 
 
 
367 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  38.51 
 
 
355 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  27.66 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  29.76 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  30.45 
 
 
369 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  29.56 
 
 
375 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  29.07 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  28.92 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  26.19 
 
 
545 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  30.82 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  27.08 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>