33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0455 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  100 
 
 
375 aa  724    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  56.01 
 
 
545 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  56.77 
 
 
435 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  51.6 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  50.27 
 
 
376 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  35.83 
 
 
374 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  38.96 
 
 
355 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  37.15 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  38.3 
 
 
366 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  34.76 
 
 
377 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  36.59 
 
 
377 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  30.45 
 
 
378 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  31.35 
 
 
378 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  36.25 
 
 
374 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  35.02 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  33.24 
 
 
375 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  31.83 
 
 
372 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  29.94 
 
 
393 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  28.23 
 
 
384 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  29.56 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  27.51 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  34.17 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  29.55 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  31.49 
 
 
331 aa  84  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  26.69 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  26.26 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  26.37 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  30.08 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  24.44 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  30.38 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  26.81 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  24.12 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>