33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1186 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  100 
 
 
384 aa  771    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  34.88 
 
 
377 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  33.24 
 
 
374 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  37.21 
 
 
378 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  32 
 
 
397 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  33.53 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  36.46 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  28.65 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  29.84 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  32.25 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  34 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  29.27 
 
 
377 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  34.94 
 
 
355 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  28.83 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  34.13 
 
 
370 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  28.7 
 
 
545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  34.07 
 
 
367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  26.81 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  33.18 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  28.23 
 
 
375 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  33.2 
 
 
369 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  28.19 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  37.5 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  31.8 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  32.1 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  34.29 
 
 
331 aa  113  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  35.43 
 
 
332 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  24.1 
 
 
375 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  34.92 
 
 
330 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  25 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  36.57 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  36.36 
 
 
335 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  34.07 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>