33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1451 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  740    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  58.11 
 
 
377 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  55.49 
 
 
397 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  52.47 
 
 
372 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  51.23 
 
 
393 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  42.66 
 
 
374 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  37.07 
 
 
378 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  37.85 
 
 
378 aa  259  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  36.9 
 
 
355 aa  222  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  38.81 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  39.51 
 
 
366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  38.08 
 
 
377 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  36.46 
 
 
545 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  38.7 
 
 
374 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  36.46 
 
 
384 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  35.47 
 
 
435 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  33.24 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  33.6 
 
 
375 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  34.41 
 
 
381 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  35.6 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  38.65 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  35.75 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  32.23 
 
 
370 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  28.61 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  31.47 
 
 
367 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  32.46 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  37.89 
 
 
332 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  38.51 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  33.72 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  36.78 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  27.31 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  27.32 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>