33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3593 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  100 
 
 		 378 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  57.98 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  47.04 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  39.46 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  37.85 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  36.41 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  34.77 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  35.9 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  32.22 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  33.63 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  33.63 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  33.53 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  32.3 
 
 		 545 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  32.22 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  30.48 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  34.69 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  30.45 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  33.42 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  40.35 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  38.5 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  40.98 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  37.99 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  31.19 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  38.95 
 
 		 369 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  37.89 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  38.42 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  33.66 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  29 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  29.44 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  29.8 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  33.53 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  29.82 
 
 		 335 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  28.02 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>