33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1730 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  683    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.234359  normal  0.75509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1924  Protein of unknown function DUF373  51.53 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393258  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1415  hypothetical protein  30.57 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0699  hypothetical protein  35.51 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.946363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3593  transmembrane protein  30.36 
 
 		 378 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.596596  normal  0.0196638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1402  hypothetical protein  32.08 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00889164  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0127  hypothetical protein  30.36 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1660  hypothetical protein  25.65 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  hitchhiker  0.00549093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1186  Protein of unknown function DUF373  38 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0294  Protein of unknown function DUF373  28.71 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0687  hypothetical protein  28.22 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0183  hypothetical protein  31.22 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000104057  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0591  hypothetical protein  27.34 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1983  hypothetical protein  29.74 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0314  Protein of unknown function DUF373  30.05 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.141585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0944  hypothetical protein  30.66 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0413092  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0614  hypothetical protein  28.98 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0741  hypothetical protein  31.45 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.680654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1384  Protein of unknown function DUF373  30.28 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1833  Protein of unknown function DUF373  30.56 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3336  Protein of unknown function DUF373  30.14 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0948  Protein of unknown function DUF373  30.41 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.282892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2611  Protein of unknown function DUF373  26.37 
 
 		 545 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2827  Protein of unknown function DUF373  28.63 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.205795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1451  hypothetical protein  28.23 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0002  hypothetical protein  26.78 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000010754  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0434  hypothetical protein  25.08 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00057767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0455  Protein of unknown function DUF373  24.91 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.669189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1352  Protein of unknown function DUF373  28.2 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2704  Protein of unknown function DUF373  32.21 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0361  hypothetical protein  25.11 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.168071  hitchhiker  0.00242674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0475  hypothetical protein  27.78 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1558  hypothetical protein  25.11 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.796051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>