32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0319 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0319  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 380 aa  773    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.245975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  24.84 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  23.23 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5047  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2409  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0527078 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1235  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.67 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0258695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  22.88 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  22.38 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  20.06 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8173  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  19.4 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.88 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1801  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  19.22 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.85 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.15 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.59 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.59 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  21.59 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  22.48 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  20.55 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.43 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  21.43 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.54 
 
 		 349 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3232  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4043  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0937845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4420  extracellular solute-binding protein  20.99 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1649  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.316325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>