111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3982 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4105  transposase IS4 family protein  54.04 
 
 		 384 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2760  hypothetical protein  98.1 
 
 		 152 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0869  transposase IS4 family protein  44.22 
 
 		 418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2605  hypothetical protein  41.14 
 
 		 244 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.797611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2996  hypothetical protein  40.8 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.230579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3303  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1976  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2015  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3793  transposase IS4 family protein  26.53 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 		 400 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  26.8 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  27.32 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  28.35 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06245  hypothetical protein  27.89 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  27.13 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  26.6 
 
 		 405 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1845  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0185654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1902  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0975496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3147  transposase, IS4 family protein  27.78 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  26.6 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  26.6 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  26.6 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  26.6 
 
 		 399 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  25.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  25.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  25.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  25.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  25.41 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  26.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  26.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1949  putative transposase  26.67 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  26.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  26.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  26.67 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  26.67 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  26.15 
 
 		 402 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  26.15 
 
 		 402 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  26.74 
 
 		 399 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1910  hypothetical protein  29.61 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25520  Transposase, IS4  26.18 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  26.15 
 
 		 420 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 		 378 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01477  hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  30.89 
 
 		 383 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  30.89 
 
 		 383 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45960  Transposase, IS4  25.65 
 
 		 397 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  25.95 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0125  hypothetical protein  25.62 
 
 		 398 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05883  hypothetical protein  27.4 
 
 		 346 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  23.2 
 
 		 404 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  23.76 
 
 		 404 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  23.76 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  23.76 
 
 		 460 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00634  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01507  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01863  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02154  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03192  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04334  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05638  ISXoo8 transposase  28.11 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01801  ISXoo8 transposase  30.14 
 
 		 407 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04657  ISXoo8 transposase  30.07 
 
 		 407 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.18331  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02581  ISXoo8 transposase  30.14 
 
 		 404 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  23.2 
 
 		 404 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  26.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>