172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1949 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1949  putative transposase  100 
 
 		 224 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  100 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  98.56 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  98.95 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  98.95 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  98.95 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  99.48 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  98.95 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  99.48 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  99.48 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  78.31 
 
 		 400 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  78.31 
 
 		 400 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  78.31 
 
 		 400 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  78.31 
 
 		 400 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  78.31 
 
 		 400 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  76.72 
 
 		 400 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  76.19 
 
 		 400 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  76.19 
 
 		 400 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  75.66 
 
 		 400 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1849  putative transposase  91.89 
 
 		 150 aa  275  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  63.68 
 
 		 405 aa  265  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  63.68 
 
 		 399 aa  265  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  63.68 
 
 		 399 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  63.68 
 
 		 399 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  63.68 
 
 		 399 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  63.68 
 
 		 399 aa  264  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  63.16 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  63.16 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  63.16 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  63.16 
 
 		 399 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  62.63 
 
 		 399 aa  262  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  62.63 
 
 		 399 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  61.58 
 
 		 312 aa  255  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01477  hypothetical protein  62.43 
 
 		 212 aa  248  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06245  hypothetical protein  61.05 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  59.26 
 
 		 402 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  55.38 
 
 		 334 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  55.38 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  54.84 
 
 		 404 aa  218  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  54.84 
 
 		 404 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  54.3 
 
 		 460 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  54.3 
 
 		 404 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05883  hypothetical protein  68.38 
 
 		 346 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  78.79 
 
 		 310 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1845  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 		 397 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0185654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1902  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 		 397 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0975496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3147  transposase, IS4 family protein  40.22 
 
 		 397 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0903  hypothetical protein  77.38 
 
 		 84 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.406041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25520  Transposase, IS4  43.48 
 
 		 400 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45960  Transposase, IS4  43.48 
 
 		 397 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02343  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02511  hypothetical protein  39.52 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05431  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00244  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00547  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00551  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00587  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00840  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01147  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01480  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01644  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01678  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01679  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01845  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05717  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05605  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05898  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05505  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06115  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03107  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03320  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03328  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03453  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05081  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05114  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05129  hypothetical protein  39.52 
 
 		 397 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>