29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1535 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1535    100 
 
 		 1085 bp  2151    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0087812  normal  0.866101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0086    93.62 
 
 		 3246 bp  69.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  87.72 
 
 		 1005 bp  58  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  87.72 
 
 		 1026 bp  58  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  87.72 
 
 		 1050 bp  58  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  87.72 
 
 		 1005 bp  58  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  87.72 
 
 		 1005 bp  58  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  87.72 
 
 		 1020 bp  58  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  87.72 
 
 		 1020 bp  58  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  87.72 
 
 		 1005 bp  58  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  90.48 
 
 		 1017 bp  52  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  90.48 
 
 		 1032 bp  52  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  91.89 
 
 		 1047 bp  50.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  83.56 
 
 		 1122 bp  50.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2756  hypothetical protein  91.89 
 
 		 558 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0464  hypothetical protein  91.89 
 
 		 633 bp  50.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2896  hypothetical protein  91.89 
 
 		 627 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6169  hypothetical protein  91.89 
 
 		 627 bp  50.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  96.43 
 
 		 1002 bp  48.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  100 
 
 		 1257 bp  48.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6180  monosaccharide-transporting ATPase  93.75 
 
 		 1062 bp  48.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  87.5 
 
 		 1098 bp  48.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6575  inner-membrane translocator  93.75 
 
 		 1062 bp  48.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2996  Monosaccharide-transporting ATPase  96.43 
 
 		 1179 bp  48.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  96.43 
 
 		 717 bp  48.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 243 bp  48.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00527243  hitchhiker  0.000345202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29460  multiple monosaccharide ABC transporter membrane protein  96.43 
 
 		 1182 bp  48.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1257  inner-membrane translocator  93.75 
 
 		 1062 bp  48.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1015  transmembrane ABC transporter protein  88.64 
 
 		 1047 bp  48.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>