31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0086 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0086    100 
 
 
3246 bp  6435    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  82.43 
 
 
1446 bp  228  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  89.36 
 
 
1416 bp  107  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  87.91 
 
 
1476 bp  93.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2328  amino acid permease-associated region  91.07 
 
 
1404 bp  71.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  0.251139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  86.67 
 
 
1425 bp  69.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1535    93.62 
 
 
1085 bp  69.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0087812  normal  0.866101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  85.71 
 
 
1488 bp  65.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  82.18 
 
 
1485 bp  58  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2372  amino acid permease-associated region  87.5 
 
 
1404 bp  56  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  94.29 
 
 
1401 bp  54  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  84.51 
 
 
1446 bp  54  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  94.29 
 
 
1407 bp  54  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  94.29 
 
 
1407 bp  54  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  94.29 
 
 
1407 bp  54  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  94.29 
 
 
1407 bp  54  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  94.29 
 
 
1404 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1831  hypothetical protein  96.55 
 
 
1212 bp  50.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2649  amino acid permease-associated region  93.94 
 
 
1404 bp  50.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.925431  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  93.94 
 
 
1632 bp  50.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  90.24 
 
 
1617 bp  50.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  96.55 
 
 
1620 bp  50.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  96.55 
 
 
1431 bp  50.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  96.55 
 
 
1398 bp  50.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>