More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0493 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.81 
 
 
118 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.81 
 
 
108 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.81 
 
 
108 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.81 
 
 
108 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.01 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
108 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  56.48 
 
 
110 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  59.22 
 
 
113 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  54.63 
 
 
110 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  53.7 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  54.29 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.85 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  51.85 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  51.4 
 
 
109 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
116 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  50.48 
 
 
108 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  50.48 
 
 
108 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.51 
 
 
141 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
108 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
109 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
107 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  46.15 
 
 
122 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
109 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  44.34 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.44 
 
 
110 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
128 aa  104  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
110 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
128 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  43.12 
 
 
117 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  43.1 
 
 
113 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
116 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  47.17 
 
 
108 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
108 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
108 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.84 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  45.87 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.17 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.17 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.17 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.17 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  42.2 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.23 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.64 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42 
 
 
102 aa  94.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.45 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  37.38 
 
 
116 aa  94  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
114 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.66 
 
 
118 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  36.7 
 
 
113 aa  94  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
122 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.17 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.6 
 
 
116 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.89 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.7 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.89 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.45 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.81 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.07 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.05 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.45 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.07 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.72 
 
 
123 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.21 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  38.18 
 
 
113 aa  92  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.72 
 
 
123 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  38.53 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.38 
 
 
115 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.25 
 
 
121 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.4 
 
 
116 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.4 
 
 
116 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.4 
 
 
116 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.6 
 
 
124 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  40.35 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>