More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1730 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
110 aa  223  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  85.19 
 
 
109 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  82.41 
 
 
107 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  75.93 
 
 
108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.93 
 
 
108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.15 
 
 
108 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.93 
 
 
111 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  51.92 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  48.62 
 
 
109 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.92 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  49.04 
 
 
108 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  49.04 
 
 
108 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  52.38 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  54.29 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  49.07 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 
110 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  50.49 
 
 
113 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
130 aa  105  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.91 
 
 
128 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  54.35 
 
 
124 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.49 
 
 
116 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  46.85 
 
 
113 aa  105  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
110 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
128 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
108 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.92 
 
 
110 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 
108 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  51.4 
 
 
117 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  46.85 
 
 
113 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  50.49 
 
 
130 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
108 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.85 
 
 
111 aa  100  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
110 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
121 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.17 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.95 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.49 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
105 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  48.08 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.02 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  45.05 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.09 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.09 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.17 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.09 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.14 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  44.44 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
121 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.88 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
114 aa  95.9  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  50 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.09 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.64 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  45.28 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>