More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1156 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
109 aa  222  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  83.02 
 
 
110 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  77.14 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  83.96 
 
 
110 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  71.43 
 
 
108 aa  165  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  71.43 
 
 
108 aa  165  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.57 
 
 
108 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  69.16 
 
 
110 aa  156  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.26 
 
 
107 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  57.27 
 
 
110 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  57.55 
 
 
110 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  57.14 
 
 
110 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.72 
 
 
109 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  55.05 
 
 
109 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  55.66 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  58.25 
 
 
113 aa  129  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.32 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.55 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.92 
 
 
141 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  48.15 
 
 
130 aa  116  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  51.38 
 
 
108 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
108 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
108 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  52.69 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
122 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  44.04 
 
 
116 aa  105  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
116 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  48.08 
 
 
117 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
121 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
121 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
128 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.45 
 
 
123 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
124 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  48.54 
 
 
109 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
126 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
124 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
126 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  46.79 
 
 
107 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
124 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
121 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
108 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
120 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  40.91 
 
 
113 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.12 
 
 
121 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  43.64 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
121 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
128 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
121 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
110 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
122 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
128 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
116 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
130 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
120 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.12 
 
 
120 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
108 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  42.45 
 
 
107 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
122 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
116 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
124 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
124 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
115 aa  100  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  45.63 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>