More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0901 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  82.41 
 
 
110 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  83.33 
 
 
109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  73.15 
 
 
108 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  73.15 
 
 
108 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.22 
 
 
108 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.16 
 
 
111 aa  153  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.37 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.46 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  53.4 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  50.49 
 
 
108 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  50.49 
 
 
108 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  53.4 
 
 
113 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  52.88 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.98 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  49.54 
 
 
109 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  52.43 
 
 
110 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  52.43 
 
 
110 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.81 
 
 
108 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.51 
 
 
110 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  50.48 
 
 
130 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.85 
 
 
108 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
108 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
108 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
107 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.49 
 
 
108 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  47.57 
 
 
110 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  54.02 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.01 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
118 aa  98.2  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.12 
 
 
110 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  41.82 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  54.22 
 
 
128 aa  96.7  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.43 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  43.12 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  53.01 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  53.01 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0445  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
123 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.361267  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
114 aa  93.6  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.63 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
115 aa  93.2  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  44.04 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.55 
 
 
121 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.95 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  45.79 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
123 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0155  HesB/YadR/YfhF  51.22 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
121 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
130 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
121 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.6 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  41.82 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
105 aa  91.3  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.64 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.59 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.72 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  55.56 
 
 
106 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  44.55 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>