More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2658 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  100 
 
 
108 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  96.3 
 
 
108 aa  214  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  75.93 
 
 
109 aa  174  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.93 
 
 
110 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  73.15 
 
 
107 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  72.22 
 
 
111 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.4 
 
 
110 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  52.43 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  52.43 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.31 
 
 
110 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.14 
 
 
116 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.37 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  51.46 
 
 
110 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  48.62 
 
 
109 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  51.46 
 
 
110 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  53.4 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  53.4 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  53.4 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.34 
 
 
116 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  51.46 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.29 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  52.38 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.34 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.91 
 
 
124 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.47 
 
 
124 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.29 
 
 
121 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.82 
 
 
110 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.91 
 
 
124 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.47 
 
 
128 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.38 
 
 
116 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  49.07 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
128 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.18 
 
 
123 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  48.6 
 
 
117 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.18 
 
 
123 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.18 
 
 
123 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
109 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.09 
 
 
121 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.18 
 
 
123 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
123 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.46 
 
 
121 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  49.54 
 
 
121 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.07 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.54 
 
 
121 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
118 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
123 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.18 
 
 
121 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.46 
 
 
124 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
121 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
121 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
121 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  46.36 
 
 
113 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.54 
 
 
120 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
123 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
130 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.46 
 
 
124 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
124 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  45.45 
 
 
113 aa  103  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.27 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.37 
 
 
110 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
108 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.95 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49 
 
 
102 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
117 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
115 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
114 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.09 
 
 
120 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.17 
 
 
132 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  49.51 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.51 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.17 
 
 
132 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
124 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.17 
 
 
132 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
115 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.53 
 
 
126 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
114 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
122 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.09 
 
 
132 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
139 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  48.6 
 
 
113 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.49 
 
 
116 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.79 
 
 
116 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
108 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
114 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
114 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.3 
 
 
114 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>