More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2770 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  87.04 
 
 
108 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  87.04 
 
 
108 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  87.04 
 
 
108 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  82.41 
 
 
108 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  81.48 
 
 
108 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.11 
 
 
116 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  62.62 
 
 
110 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.01 
 
 
114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  62.86 
 
 
110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  60.95 
 
 
110 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
118 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  57.41 
 
 
108 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  57.41 
 
 
108 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  56.07 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.72 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  60.19 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  56.07 
 
 
109 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.94 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
110 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
110 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
107 aa  120  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
116 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
110 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
109 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  46.79 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  43.4 
 
 
130 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
116 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
128 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
122 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
121 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
118 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.74 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
117 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.51 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  41.9 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  47.57 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  38.68 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
130 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  44.55 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.9 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.63 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  46.6 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2450  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  40 
 
 
123 aa  94  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  43.69 
 
 
108 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
109 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
108 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
117 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
127 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  46.73 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  42.06 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
115 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
122 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
108 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2752  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  39.05 
 
 
123 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.12 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.12 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.12 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.12 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.12 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  36.19 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  39.25 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.19 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.68 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  38.1 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.68 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.89 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
116 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>