56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1133 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  100 
 
 
153 aa  294  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  86.27 
 
 
154 aa  254  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  85.43 
 
 
152 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  76.87 
 
 
154 aa  203  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  57.89 
 
 
181 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  41.96 
 
 
146 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  41.96 
 
 
146 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  43.07 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  38 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  27.27 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  37.61 
 
 
213 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
213 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
203 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
209 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  41.18 
 
 
207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  42.42 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  35.35 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 
150 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  35.35 
 
 
214 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  32.09 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  40.2 
 
 
228 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  37.17 
 
 
227 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  33.02 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  36.52 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  36.28 
 
 
225 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  34.65 
 
 
207 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  36.52 
 
 
202 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  33.02 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  36.52 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  28.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  38 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  21.53 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  35.04 
 
 
209 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  24.07 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  24.46 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  37 
 
 
202 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  29.59 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  27.61 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  34 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  32.63 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  33.67 
 
 
216 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  21.95 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  35.35 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  28.57 
 
 
173 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  34.34 
 
 
166 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
149 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  27.4 
 
 
161 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  28.67 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  36 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>