37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2200 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 146 aa  289  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  96.58 
 
 		 146 aa  279  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  48.25 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  44.06 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  41.96 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  45.83 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  38.57 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  29.2 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  29.2 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  27.91 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  31.58 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  27.41 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  30.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  30.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  23.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1134  urease accessory protein UreE  31.15 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  25.44 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3557  urease accessory protein UreE  31.15 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0396444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1080  urease accessory protein UreE  31.15 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  25.44 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  31.45 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  26.09 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  30.77 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  30.77 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  32 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  31.46 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  31 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  30.1 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  28.04 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  28.85 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  29.52 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  24 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  31.25 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  22.48 
 
 		 172 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>