39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1304 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  83.18 
 
 		 217 aa  351  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  52.54 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3557  urease accessory protein UreE  51.63 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0396444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1134  urease accessory protein UreE  51.63 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1080  urease accessory protein UreE  51.63 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  51.98 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3481  UreE urease accessory domain-containing protein  27.32 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  32.03 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  28.43 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  29.93 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  26.99 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  26 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  27.13 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  28.11 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  35.48 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  29.17 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0750  hypothetical protein  29.46 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  33.02 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  31.85 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  34.17 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  31.85 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  32.08 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  32.08 
 
 		 154 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  34.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  36.19 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  29.91 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  30.64 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  31.94 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  31.25 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  30.84 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  31.73 
 
 		 171 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  33.94 
 
 		 175 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>