71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0686 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 151 aa  303  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  60.67 
 
 		 149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  60.67 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  60.67 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  59.33 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  45.33 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  44.1 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  43.48 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  39.39 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  39.19 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  35.29 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  32.24 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  30.19 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  32.7 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  28.7 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0721  UreE urease accessory domain protein  29.85 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  28.79 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  30.63 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  24.44 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  25.23 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  27.27 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  28.09 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  26.72 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  25 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  31.07 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  30.34 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  24.14 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 214 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  27.08 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  24.14 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  24.46 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  30 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  27.36 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  23.08 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  24.34 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  26.32 
 
 		 211 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  23.28 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  25.86 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  27.52 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  24.32 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  26.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  23.2 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  28.23 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  28.57 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  25.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  28.83 
 
 		 149 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  26.73 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  25.78 
 
 		 166 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  25 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  25.74 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  27.37 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  25.74 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  27.72 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 203 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  30.23 
 
 		 149 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  22.52 
 
 		 213 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>