52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0244 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  81.99 
 
 
161 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  58.58 
 
 
165 aa  187  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  47.83 
 
 
149 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  44.1 
 
 
151 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  44.44 
 
 
151 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  35.26 
 
 
149 aa  100  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  35.34 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  30.56 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  27.33 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
167 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  31.09 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  29.82 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  31.58 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  33.67 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  29.46 
 
 
227 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  32.03 
 
 
206 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  31.96 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  29.82 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  28.47 
 
 
181 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  32.14 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  32.14 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  29.13 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  28.12 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  27.33 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  30 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  27.08 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  30.36 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  31.25 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  27.33 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  29.91 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0721  UreE urease accessory domain protein  26.24 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  30.5 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  28.95 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  27.73 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  28.81 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  36.23 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  27.4 
 
 
153 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
213 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
203 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
207 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
205 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
203 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
210 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
202 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
204 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  29.06 
 
 
224 aa  40.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>