115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1872 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 150 aa  302  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  90 
 
 		 150 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  90 
 
 		 150 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  66 
 
 		 149 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  59.33 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  49.07 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  45.33 
 
 		 151 aa  141  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  46.43 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  41.5 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  36.84 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  34.78 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  30.15 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  27.19 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  32.43 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  27.19 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  30.63 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  31.2 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  27.93 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0271  urease accessory protein UreE  27.56 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.591299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  35.48 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0285  urease accessory protein UreE  27.56 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.735349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  25.19 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  25.19 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  32.94 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  26.43 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  28.83 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0336  urease accessory protein UreE  26.77 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  29.73 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  31.52 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  28.97 
 
 		 218 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  30.63 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  26.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  26.27 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  27.43 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  33.33 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  26.42 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  24.22 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  27.41 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  25.44 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  34.83 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  28.36 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  25 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  25.23 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  27.19 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  27.03 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  26.44 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  26.44 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  28.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  26.4 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  25.87 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  26.44 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  29.25 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  25 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  26.44 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  29.25 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  24.26 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  28.7 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  26.44 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  26.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  29.09 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  26.42 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  25.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  25.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  28.97 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  21.71 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  29.75 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  32.98 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  25.23 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  25 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  31.18 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  28.72 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  28.28 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  26.09 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  26.61 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  25 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  26.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  28.04 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  30.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  29.75 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  25.56 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  28.7 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  26.14 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  26.85 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  26.67 
 
 		 210 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>