40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1554 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  100 
 
 
224 aa  420  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1134  urease accessory protein UreE  29.52 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1080  urease accessory protein UreE  29.52 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3557  urease accessory protein UreE  30.19 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0396444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  26.87 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0750  hypothetical protein  24.31 
 
 
175 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  21.19 
 
 
172 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  30.2 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  30.2 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  30.77 
 
 
202 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  30.13 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  32.05 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  27.62 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  30.7 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  30.7 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 
204 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  31.21 
 
 
211 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  34.09 
 
 
149 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  33.87 
 
 
161 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  30.07 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  27.56 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  29.49 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  31.07 
 
 
146 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  31.46 
 
 
146 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 
205 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  27.04 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  31.87 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  29.49 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  28.23 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  31.41 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  30.52 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  31.25 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  24.03 
 
 
150 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
873 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  25.95 
 
 
152 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>