114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4246 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  79.64 
 
 		 174 aa  268  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  82.78 
 
 		 220 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  80.13 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  84.83 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  74.23 
 
 		 234 aa  253  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  78 
 
 		 217 aa  244  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  73.79 
 
 		 168 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  63.52 
 
 		 216 aa  190  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  53.5 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  45.55 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  48.82 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  52.87 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  48.24 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  51.59 
 
 		 228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  42.11 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  44.97 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  49.06 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  44.97 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  49.06 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  49.06 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  49.06 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  43.72 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  47.8 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  47.8 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  47.8 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  47.8 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  47.17 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  47.17 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  47.17 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  49.33 
 
 		 165 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  50.38 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  50 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  48.06 
 
 		 143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  44.96 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  48.85 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  48.85 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  46.67 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  47.29 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  45.14 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  47.37 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  42.04 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  44.36 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  41.98 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  37.82 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  39.23 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  42.86 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1324  urease accessory protein UreE  44.52 
 
 		 154 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  41.09 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  42.74 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  38.03 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  44.35 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  45.53 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  40 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  41.6 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  43.33 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3467  urease accessory protein UreE  46.56 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0028527  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  45.79 
 
 		 171 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  35.25 
 
 		 152 aa  91.3  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  35.54 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  37.93 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  42.65 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  39.42 
 
 		 147 aa  88.2  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  41.13 
 
 		 163 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  40.83 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  34.21 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  34.21 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2623  urease accessory protein UreE  42.65 
 
 		 149 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0608475  normal  0.513039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  38.1 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  38.26 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1028  UreE urease accessory domain-containing protein  36.67 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  39.37 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  36.14 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  35.16 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0883  UreE urease accessory-like  36.09 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  33.73 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  32.89 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  34.9 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  32.54 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  35.57 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  38.98 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  33.33 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  32.74 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  34.35 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  34.81 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  39.2 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2253  urease accessory protein UreE  37.12 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  35.94 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3682  UreE urease accessory domain-containing protein  37.27 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  30.6 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  37.19 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  30.91 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  32.73 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1051  urease accessory protein E  32.84 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  37.74 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19221  urease accessory protein UreE  32.09 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.447195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0882  UreE urease accessory domain protein  33.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.219178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0944  UreE urease accessory domain-containing protein  31.58 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0900984  normal  0.101543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>