114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3531 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  77.27 
 
 
193 aa  275  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  77.59 
 
 
174 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  80.62 
 
 
234 aa  268  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  71.43 
 
 
208 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  66.67 
 
 
220 aa  261  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  82.55 
 
 
217 aa  255  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  74.48 
 
 
168 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  67.92 
 
 
216 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  53.68 
 
 
211 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  52.02 
 
 
225 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  54.37 
 
 
227 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  53.45 
 
 
214 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  52.87 
 
 
208 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  52.83 
 
 
207 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  52.83 
 
 
204 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  52.83 
 
 
202 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  52.83 
 
 
202 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  52.83 
 
 
210 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  50.29 
 
 
196 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  51.45 
 
 
228 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  50.57 
 
 
221 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  50 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  45.26 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  50.94 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  51.57 
 
 
213 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  50.94 
 
 
203 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  50.94 
 
 
205 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  50.94 
 
 
207 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  50.31 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  50.31 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  50.31 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  49.68 
 
 
165 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  54.89 
 
 
163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  52.48 
 
 
161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  51.13 
 
 
184 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  51.16 
 
 
167 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  51.16 
 
 
167 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  48.99 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  46.34 
 
 
186 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  46.83 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  45.04 
 
 
175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  48.41 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  46.26 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  42.33 
 
 
147 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  43.08 
 
 
176 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  43.33 
 
 
215 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1324  urease accessory protein UreE  45.83 
 
 
154 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  46.1 
 
 
168 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  42.96 
 
 
206 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  38.1 
 
 
182 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  38.1 
 
 
182 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  38.79 
 
 
173 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  44.22 
 
 
182 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  41.86 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3467  urease accessory protein UreE  48.09 
 
 
152 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0028527  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  45.08 
 
 
160 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  47.66 
 
 
171 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  43.55 
 
 
166 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  43.55 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  43.48 
 
 
163 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  38.73 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  45 
 
 
167 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  41.6 
 
 
166 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  42.4 
 
 
166 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  40.29 
 
 
147 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  44.17 
 
 
167 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1028  UreE urease accessory domain-containing protein  36.96 
 
 
202 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  40.27 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2623  urease accessory protein UreE  44.93 
 
 
149 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0608475  normal  0.513039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  39.01 
 
 
166 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  34.76 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  32.85 
 
 
152 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  38.71 
 
 
182 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  40.6 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  40.48 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  35.57 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  37.8 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  37.01 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  40 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  41.18 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  34.92 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  38.66 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  36.5 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2253  urease accessory protein UreE  40.15 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  32.03 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0883  UreE urease accessory-like  34.57 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418799  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  33.06 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  30.84 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  37.5 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  37.7 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3682  UreE urease accessory domain-containing protein  39.09 
 
 
130 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  31.96 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1051  urease accessory protein E  37.01 
 
 
146 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  36.36 
 
 
154 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  30.84 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19221  urease accessory protein UreE  35.43 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.447195  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  30.84 
 
 
149 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0882  UreE urease accessory domain protein  34.13 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.219178  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  31.58 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>