124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0789 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  93.56 
 
 		 202 aa  344  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  88.1 
 
 		 209 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  87.5 
 
 		 207 aa  327  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  95.29 
 
 		 204 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  95.29 
 
 		 202 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  95.29 
 
 		 210 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  77.36 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  85.29 
 
 		 203 aa  283  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  85.29 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  85.29 
 
 		 207 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  84.71 
 
 		 203 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  84.71 
 
 		 213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  84.71 
 
 		 209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  78.57 
 
 		 227 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  77.98 
 
 		 225 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  75.74 
 
 		 228 aa  255  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  73.53 
 
 		 184 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  60.19 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  64.29 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  64.88 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  63.69 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  61.9 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  61.9 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  48.91 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  60 
 
 		 163 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  44.95 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  52.2 
 
 		 234 aa  148  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  52.67 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  44.33 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  44.68 
 
 		 193 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  41.04 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  50 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  51.03 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  49.7 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  50.34 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  46.21 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  55.74 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  52.17 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  48.98 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  48.98 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  55.37 
 
 		 166 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  54.55 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  47.18 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  47.59 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  48.76 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  50.39 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  51.52 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  51.59 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  44.14 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  44.83 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  46.27 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1324  urease accessory protein UreE  45.86 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  51.69 
 
 		 160 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  46.26 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  44.19 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  44.19 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  47.24 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  43.18 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  42.97 
 
 		 147 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  41.6 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  46.88 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  43.8 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3467  urease accessory protein UreE  48.78 
 
 		 152 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0028527  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  38.71 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  45.53 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  35.77 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  37.95 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  38.01 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  43.31 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  37.4 
 
 		 154 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  39.13 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  39.13 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  44.35 
 
 		 163 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  37.68 
 
 		 173 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  42.62 
 
 		 168 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1028  UreE urease accessory domain-containing protein  35.57 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  46.23 
 
 		 171 aa  91.3  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3682  UreE urease accessory domain-containing protein  49.54 
 
 		 130 aa  91.3  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  39.53 
 
 		 154 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  43.33 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  42.74 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  39.68 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  43.09 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  40.62 
 
 		 182 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  43.65 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  35.88 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0883  UreE urease accessory-like  40.16 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  34.96 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  37.69 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  38.93 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  41.73 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2623  urease accessory protein UreE  39.33 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0608475  normal  0.513039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  38.84 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1051  urease accessory protein E  38.24 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  36.59 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0944  UreE urease accessory domain-containing protein  39.34 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0900984  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19221  urease accessory protein UreE  35.56 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.447195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0882  UreE urease accessory domain protein  40.16 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.219178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2004  UreE urease accessory domain-containing protein  39.34 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.761322  normal  0.0598469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>