106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1051 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1051  urease accessory protein E  100 
 
 
146 aa  293  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19221  urease accessory protein UreE  93.84 
 
 
146 aa  274  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.447195  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2253  urease accessory protein UreE  52.38 
 
 
160 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  47.48 
 
 
181 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2623  urease accessory protein UreE  44.68 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0608475  normal  0.513039 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  44.8 
 
 
149 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  44.44 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  44 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  43.2 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  37.68 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  41.27 
 
 
208 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  38.35 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  42.52 
 
 
211 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  40.8 
 
 
214 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  36.81 
 
 
168 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  39.71 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  39.71 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  39.71 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  39.71 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  39.71 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  38.97 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  38.24 
 
 
204 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  33.58 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  38.24 
 
 
202 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  34.78 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  38.24 
 
 
210 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  38.24 
 
 
196 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  38.97 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  38.97 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  38.97 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  34.06 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  39.37 
 
 
206 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  32.85 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  34.06 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  37.82 
 
 
166 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  35.92 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  34.11 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  43.12 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  40.94 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  35.07 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  37.06 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  35.56 
 
 
227 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  34.81 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  35.56 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  32.87 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  37.4 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  34.93 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  34.93 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  36.11 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  33.79 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1324  urease accessory protein UreE  30.99 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  34.15 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3682  UreE urease accessory domain-containing protein  40.17 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  37.01 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  36.97 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  43.96 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  31.03 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  37.29 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  40.86 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  36.78 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  37.5 
 
 
208 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  41.76 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  39.42 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  29.23 
 
 
215 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3467  urease accessory protein UreE  32.39 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0028527  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  32.62 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  34.62 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  33.05 
 
 
211 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  33.11 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  35.77 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  30.58 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  36.43 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  32.2 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  32.84 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  33.33 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  35 
 
 
220 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  30.08 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  32.47 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  32.2 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  29.01 
 
 
206 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  32.18 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  31.62 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  35.63 
 
 
218 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  39.18 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  32.18 
 
 
194 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  33.64 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0944  UreE urease accessory domain-containing protein  30.77 
 
 
212 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0900984  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  29.66 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  34.31 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  35.53 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  35.53 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  32.18 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  34.67 
 
 
176 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  32.18 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  33.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0883  UreE urease accessory-like  32.65 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418799  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2004  UreE urease accessory domain-containing protein  28.41 
 
 
233 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.761322  normal  0.0598469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  34.67 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  32.5 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0336  urease accessory protein UreE  32 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>