114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4180 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  100 
 
 		 218 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  88.36 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  83.92 
 
 		 211 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  81.51 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  52.81 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  57.34 
 
 		 169 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  54.66 
 
 		 163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  59.68 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  56.64 
 
 		 164 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  55.32 
 
 		 158 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  55.8 
 
 		 163 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  51.65 
 
 		 163 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  47.25 
 
 		 172 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  46.34 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  42.5 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1028  UreE urease accessory domain-containing protein  43.28 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_004310  BR0271  urease accessory protein UreE  48.25 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.591299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  43.43 
 
 		 193 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0285  urease accessory protein UreE  47.55 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.735349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  42.86 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0336  urease accessory protein UreE  47.18 
 
 		 170 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  41.76 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  48.89 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  41.76 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  45.86 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  46.1 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  49.19 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  43.15 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  37.97 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  42.47 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  45.45 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  42.29 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  46.46 
 
 		 163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1426  UreE urease accessory, N-terminal:UreE urease accessory, C-terminal  44.53 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  38.55 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  45.99 
 
 		 171 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0990  urease accessory protein UreE  46.21 
 
 		 182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  44.44 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  43.45 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  42.55 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  34.72 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  42.55 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  47.97 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  43.97 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  41.62 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  43.26 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  45.32 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  39.53 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  44.19 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  47.2 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  46.15 
 
 		 161 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  48.39 
 
 		 185 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  42.55 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  42.55 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  42.55 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  45.45 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  45.45 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  41.84 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  41.84 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  41.84 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  41.36 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  40.5 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  39.59 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  33.52 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  43.55 
 
 		 168 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  41.8 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4907  UreE urease accessory domain protein  44.2 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.047168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  43.31 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  42.62 
 
 		 160 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0944  UreE urease accessory domain-containing protein  41.43 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0900984  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0882  UreE urease accessory domain protein  42.14 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.219178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  43.75 
 
 		 163 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2879  UreE urease accessory-like  39.37 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3940  urease accessory protein UreE  44.03 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  41.8 
 
 		 143 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  36.36 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2004  UreE urease accessory domain-containing protein  38.57 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.761322  normal  0.0598469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1324  urease accessory protein UreE  42.22 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  40.46 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  42.24 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  40.52 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  40.52 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3467  urease accessory protein UreE  45.57 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0028527  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0957  urease accessory protein UreE  36.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  37.4 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29771  hypothetical protein  37.41 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4909  urease accessory protein UreE  37.93 
 
 		 166 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4451  urease accessory protein UreE  37.93 
 
 		 166 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.862823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  32.39 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  38.79 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2623  urease accessory protein UreE  37.21 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0608475  normal  0.513039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  35.77 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  33.71 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0883  UreE urease accessory-like  35.11 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.418799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  32.32 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  30.08 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>