54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0326 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  39.39 
 
 
149 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  36.84 
 
 
150 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  40.15 
 
 
150 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  40.15 
 
 
150 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  33.33 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  33.99 
 
 
151 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  37.58 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  35.29 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  35.34 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  34.25 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  30.67 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  25.17 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  28.46 
 
 
225 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  27.91 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  28.7 
 
 
227 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
213 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  27.91 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  28.16 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 
210 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 
202 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  26.32 
 
 
207 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 
202 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  25.66 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  25.66 
 
 
207 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  25.66 
 
 
203 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  24.78 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  24.58 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  28 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  24.78 
 
 
213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  24.78 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  24.41 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
228 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  24.78 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  26.32 
 
 
184 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  23.53 
 
 
208 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0750  hypothetical protein  28.36 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  26.62 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  28.57 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  24.46 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  22.55 
 
 
214 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  26.73 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  26.21 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  24.51 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  21.95 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  24.03 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  26.79 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  23 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  27.96 
 
 
173 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  28.16 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  26.55 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  25 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  24.49 
 
 
215 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>