67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1815 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 153 aa  317  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  38.56 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  35.95 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  30.37 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  30.67 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  32.24 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  30 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  28.78 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  27.05 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0721  UreE urease accessory domain protein  29.92 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  27.33 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  26 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  24.41 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  23.62 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  27.56 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  27.56 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  26.62 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  23.62 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1134  urease accessory protein UreE  32.56 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3557  urease accessory protein UreE  32.56 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0396444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1080  urease accessory protein UreE  32.56 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  26.56 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  23.42 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  22.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  26.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  27.27 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  21.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  23.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1071  urease accessory protein UreE  26.47 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  25.62 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  23.88 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  24.14 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  32.91 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  30.36 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  22.05 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  24.65 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2304  UreE urease accessory-like protein  31.08 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  28.85 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0973  urease accessory protein UreE  25.36 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  33.75 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  28.04 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  29.35 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  25.23 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  25.4 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3105  urease accessory protein UreE  32.32 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  24.8 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  27.64 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2992  UreE urease accessory domain-containing protein  25.32 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.520718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  29.33 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1682  urease accessory protein UreE-like protein  25.41 
 
 		 163 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  24.04 
 
 		 174 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  24 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  22.5 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  28.7 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  25.93 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  22.61 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>