32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1475 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  46.34 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  35.95 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  35.76 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  30.92 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  30.92 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  32.7 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  27.86 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  28 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  26.25 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  27.27 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  24.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  25.76 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  28.85 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  29.23 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0721  UreE urease accessory domain protein  24.41 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  25.9 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  32.31 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  28.41 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  28.41 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  32.31 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  29.85 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  25.83 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  24.81 
 
 		 146 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  33.7 
 
 		 163 aa  42  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  27.27 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  27.18 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0563  urease accessory protein UreE  25.84 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.348746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>