40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0060 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  35.97 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  35.97 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  34.53 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4415  hypothetical protein  26.06 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  31.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1080  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1315  urease accessory protein UreE  27.45 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3557  urease accessory protein UreE  30.52 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0396444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1134  urease accessory protein UreE  29.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  31.58 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1682  urease accessory protein UreE-like protein  27.78 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  27.35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1359  urease accessory protein UreE  26.8 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  34.69 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  31.58 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  29.37 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  27.41 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  28.12 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  33.7 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  40 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  22.76 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0750  hypothetical protein  22.31 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  37.18 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  33.61 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  24.46 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  33.61 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  30.23 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  34.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0382  urease accessory protein UreE  30.28 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  36.36 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  25.83 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 		 153 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  33.06 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  32.73 
 
 		 196 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  35.04 
 
 		 202 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  33.71 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4215  UreE urease accessory domain-containing protein  39.44 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>