109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2358 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  100 
 
 
150 aa  304  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  90 
 
 
150 aa  275  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  66 
 
 
149 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0686  urease accessory protein UreE  60.67 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  49.69 
 
 
161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3661  urease accessory protein UreE  45.33 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0948552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  48.45 
 
 
161 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03450  urease accessory protein UreE  46.67 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  44.22 
 
 
149 aa  131  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0326  urease accessory protein UreE  40.15 
 
 
150 aa  100  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4834  urease accessory protein UreE  31.37 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1475  urease accessory protein UreE  30.92 
 
 
167 aa  76.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.558296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1815  urease accessory protein UreE  30.26 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  31.25 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1867  UreE urease accessory-like  30.63 
 
 
215 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0587571  normal  0.0379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0962  urease accessory protein UreE  30.77 
 
 
206 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2685  UreE urease accessory-like  32.17 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  24.81 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3048  UreE urease accessory domain protein  31.53 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.447079  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3406  UreE urease accessory-like  26.32 
 
 
174 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.321277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3691  UreE urease accessory-like  27.83 
 
 
211 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3015  UreE urease accessory domain-containing protein  25.81 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177337  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0271  urease accessory protein UreE  28.85 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.591299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1766  UreE urease accessory-like protein  28.07 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4180  UreE urease accessory domain protein  28.97 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  28.68 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09400  urease accessory protein UreE  35.48 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0285  urease accessory protein UreE  28.85 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.735349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0336  urease accessory protein UreE  29.79 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  27.48 
 
 
163 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2261  urease accessory protein UreE  29.31 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712604  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0927  urease accessory protein UreE  25.93 
 
 
227 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3470  urease accessory protein  35.29 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
214 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  27.52 
 
 
225 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3240  UreE urease accessory domain protein  26.17 
 
 
163 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  28.21 
 
 
211 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1495  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 
213 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  29.63 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3259  UreE urease accessory domain-containing protein  30.95 
 
 
173 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3304  UreE urease accessory domain protein  31.76 
 
 
194 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3204  UreE urease accessory domain protein  25.81 
 
 
169 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1192  UreE urease accessory domain-containing protein  32 
 
 
198 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.272312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2379  urease accessory protein UreE  28.8 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.165497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1181  UreE urease accessory domain-containing protein  28 
 
 
216 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.180188  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3136  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
203 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2185  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0996  urease accessory protein UreE  26.72 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.311821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3077  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3113  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
207 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  24.06 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  25.44 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1754  UreE urease accessory-like  27.05 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218637  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0722  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2556  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2058  urease accessory protein UreE  28.32 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7007  urease accessory protein UreE  28.04 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0789  UreE urease accessory domain-containing protein  31.11 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2995  urease accessory protein UreE  29.91 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1093  UreE urease accessory domain protein  29.92 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2934  urease accessory protein UreE  28.57 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.647979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0420  urease accessory protein UreE  27.59 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0447651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0899  urease accessory protein UreE  27.59 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5614  urease accessory protein UreE  29.91 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0869  urease accessory protein UreE  27.59 
 
 
210 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0778  urease accessory protein UreE  30 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  27.1 
 
 
154 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2846  urease accessory protein UreE  29.25 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0465619  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0185  urease accessory protein UreE  27.84 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.896029  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0666  urease accessory protein UreE  32.26 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279528  normal  0.021434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  27.36 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2843  urease accessory protein UreE  29.25 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318031  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2418  urease accessory protein UreE  26.87 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0276828  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  23.81 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4005  urease accessory protein UreE  27.59 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08911  urease accessory protein UreE  31.4 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0986797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00890  urease accessory protein UreE  28.26 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2865  UreE urease accessory domain-containing protein  24.3 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4246  UreE urease accessory domain protein  27.27 
 
 
193 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1207  UreE urease accessory domain-containing protein  23.28 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0304  urease accessory protein UreE  24.79 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1948  urease accessory protein UreE  24.79 
 
 
182 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0772999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1349  urease accessory protein UreE  26.14 
 
 
220 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64650  urease accessory protein UreE  30.56 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2268  urease accessory protein UreE  27.68 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0985  urease accessory protein UreE  26.32 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3531  UreE urease accessory domain-containing protein  25.96 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.411149  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1703  UreE urease accessory domain protein  26.4 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000297051 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08891  urease accessory protein UreE  29.2 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.89415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2363  urease accessory domain protein  27.66 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.664196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1725  UreE urease accessory domain-containing protein  28.41 
 
 
168 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4634  urease accessory protein UreE  27.78 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0676502  normal  0.0639295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1242  UreE urease accessory-like  26.85 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0665  urease accessory protein UreE  26.67 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2491  UreE urease accessory domain-containing protein  28.89 
 
 
209 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.967628  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4377  UreE urease accessory domain-containing protein  22.22 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00604344  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0222  Dual specificity protein phosphatase  23.93 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>