248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0617 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  94.71 
 
 
359 aa  682    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  94.43 
 
 
359 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
358 aa  715    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  74.33 
 
 
345 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  63.83 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  57.74 
 
 
344 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  54.85 
 
 
344 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  54.66 
 
 
344 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  35.46 
 
 
362 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  35.56 
 
 
340 aa  222  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  35.93 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  36.53 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  35.33 
 
 
362 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  36.45 
 
 
362 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  34.59 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  34.98 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  34.88 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  34.24 
 
 
339 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  35.39 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  31.82 
 
 
339 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  30.95 
 
 
350 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0342  flagellar motor switch protein G  34.65 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320445  normal  0.0115185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0310  flagellar motor switch protein G  34.76 
 
 
346 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4221  flagellar motor switch protein G  35.31 
 
 
351 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  31.15 
 
 
352 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0722  flagellar motor switch protein G  34.43 
 
 
347 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  31.53 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  30.94 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  30.94 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1152  flagellar motor switch protein G  32.91 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  31.85 
 
 
350 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0247  flagellar motor switch protein G  33.54 
 
 
345 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0377031  normal  0.550759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  31.21 
 
 
350 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0306  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
335 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0113  flagellar motor switch protein G  33.92 
 
 
351 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  27.63 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  25.15 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  25.9 
 
 
330 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  29.73 
 
 
336 aa  126  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  28.74 
 
 
348 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  28.11 
 
 
338 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  25.69 
 
 
330 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  25.9 
 
 
330 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  25.9 
 
 
330 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  27.71 
 
 
337 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  27.36 
 
 
336 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  24.23 
 
 
333 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  26.17 
 
 
336 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  26.67 
 
 
335 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  27.79 
 
 
335 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  29.18 
 
 
330 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  25.38 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  26.84 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  25.75 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  26.84 
 
 
335 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  25.07 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  29.07 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  27.49 
 
 
336 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  25.65 
 
 
346 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  26.13 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  25.76 
 
 
334 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1660  flagellar motor switch protein FliG  24.48 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  24.92 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  25.82 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  26.65 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  26.22 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  27 
 
 
338 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  27.83 
 
 
337 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  25.93 
 
 
336 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  26.14 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  27.36 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  25.6 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  26.02 
 
 
329 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  22.69 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  26.91 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  27.11 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  24.93 
 
 
339 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  26.04 
 
 
338 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  25.88 
 
 
334 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  25.75 
 
 
343 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  24.33 
 
 
339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  24.33 
 
 
339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  25.83 
 
 
333 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  24.04 
 
 
339 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  25.99 
 
 
339 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  24.5 
 
 
339 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2560  flagellar motor switch protein FliG  30.33 
 
 
349 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00224788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  24.84 
 
 
344 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  25.08 
 
 
339 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2464  flagellar motor switch protein FliG  30.15 
 
 
349 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00903662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  24.92 
 
 
336 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  24.92 
 
 
336 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  25.3 
 
 
329 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  25.3 
 
 
329 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  23.77 
 
 
346 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  24.78 
 
 
341 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  24.84 
 
 
338 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  23.17 
 
 
332 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  23.51 
 
 
338 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  26.69 
 
 
331 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>