253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1875 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  88.71 
 
 
363 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  84.25 
 
 
362 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  89.78 
 
 
362 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
362 aa  733    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  85.19 
 
 
362 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  83.71 
 
 
362 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  80.11 
 
 
362 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  63.45 
 
 
342 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  63.22 
 
 
340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
339 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  62.39 
 
 
339 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  56.84 
 
 
350 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  56.23 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  56.84 
 
 
351 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  56.23 
 
 
350 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  56.84 
 
 
351 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  56.84 
 
 
351 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  50.91 
 
 
350 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  50.65 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  35.51 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
359 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
359 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  31.52 
 
 
330 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  34.13 
 
 
345 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  33.13 
 
 
344 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
338 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  35.45 
 
 
340 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  32.02 
 
 
330 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  31.12 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 
330 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
335 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  29.39 
 
 
330 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  33.14 
 
 
339 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  33.73 
 
 
339 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  35.21 
 
 
336 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  32.83 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  34.86 
 
 
336 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  32.12 
 
 
335 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  30 
 
 
333 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  29.39 
 
 
330 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  35.82 
 
 
336 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  33.54 
 
 
342 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  32.1 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  36.06 
 
 
335 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  30.58 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  32.93 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  33.74 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  34.73 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  33.74 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  33.53 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  34.66 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  29.97 
 
 
344 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  32.85 
 
 
340 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  34.98 
 
 
329 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  34.06 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  32.27 
 
 
343 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  34.14 
 
 
344 aa  176  5e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  32.93 
 
 
336 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  32.93 
 
 
336 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  33.44 
 
 
333 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  33.64 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  31.58 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  32.25 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  31.74 
 
 
337 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  31.76 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  32.13 
 
 
339 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  32.13 
 
 
339 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  31.83 
 
 
339 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  31.83 
 
 
339 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  32.82 
 
 
360 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
336 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  31.94 
 
 
334 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  31.25 
 
 
339 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 
336 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  32.5 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  28.57 
 
 
343 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  33.44 
 
 
330 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  30.53 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0138  flagellar motor switch protein FliG  30.75 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.902934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  30.54 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.54 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  30.54 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  29.73 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  31 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.86 
 
 
347 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  30.24 
 
 
348 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  30.24 
 
 
348 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  29.69 
 
 
346 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  31.08 
 
 
349 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  29.25 
 
 
348 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  30.15 
 
 
338 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  30.58 
 
 
337 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
344 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  30.91 
 
 
333 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  30.27 
 
 
338 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 
346 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  30.46 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2560  flagellar motor switch protein FliG  32.84 
 
 
349 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00224788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>