249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1288 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 		 344 aa  690    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  48.92 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  48.61 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  48.61 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  41.46 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  40.85 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  41.19 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  41.19 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  39.82 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  40.18 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  40.37 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  42.94 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  42.94 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  40.37 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  39.51 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  39.75 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  40.25 
 
 		 339 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  38.86 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  38.86 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  42.02 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  38.55 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  39.62 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  38.77 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  38.84 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  38.99 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  37.95 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  39.88 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  37.24 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  39.02 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  37.15 
 
 		 349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  36.84 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  37.92 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  36.73 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  36.68 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  36.68 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  36.68 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  40.43 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  36.36 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  36.36 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2935  flagellar motor switch protein FliG  40.75 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  36.99 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  38.36 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  39.2 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  37.13 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  39.2 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  37.99 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  35.74 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  38.27 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  39.27 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  35.74 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  35.74 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  37.16 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  37.58 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  36.11 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  36.73 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  36.73 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  36.78 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  35.8 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  38.23 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  35.8 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  35.8 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  39.09 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  37.04 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  36.11 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  36.11 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  36.11 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  36.86 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  37.61 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  35.19 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  35.19 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  36.62 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  36.28 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  37.39 
 
 		 333 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  36.59 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  36.59 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  36.59 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  36.89 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  36.89 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.296587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2128  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1272  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.674292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4169  flagellar motor switch protein FliG  38.91 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  37.2 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  36.28 
 
 		 330 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  35.65 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>