247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1092 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
344 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  58.77 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  58.77 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  59.19 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  58.43 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  56.97 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  54.33 
 
 
344 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  52.55 
 
 
344 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  34.36 
 
 
362 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
362 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  32.25 
 
 
362 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  32.83 
 
 
362 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  32.83 
 
 
362 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
362 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  32.22 
 
 
363 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  33.23 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  32.72 
 
 
340 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  31.53 
 
 
339 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0342  flagellar motor switch protein G  32.93 
 
 
346 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320445  normal  0.0115185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  31.4 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4221  flagellar motor switch protein G  33.23 
 
 
351 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0310  flagellar motor switch protein G  32.93 
 
 
346 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  29.85 
 
 
342 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0722  flagellar motor switch protein G  32.08 
 
 
347 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1152  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
362 aa  176  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  30.69 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0247  flagellar motor switch protein G  32.62 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0377031  normal  0.550759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  30.72 
 
 
352 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  31.4 
 
 
350 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  30.89 
 
 
351 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  30.85 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  30.85 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  30.51 
 
 
350 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0113  flagellar motor switch protein G  31.67 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0306  flagellar motor switch protein G  33.33 
 
 
335 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  26.88 
 
 
336 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  25.97 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  27.55 
 
 
338 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  27.1 
 
 
348 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  25.75 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  26.57 
 
 
340 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  26.17 
 
 
336 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  25.39 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  25.73 
 
 
347 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  25.08 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  26.05 
 
 
342 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  24.53 
 
 
336 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  23.62 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  24.33 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  26.93 
 
 
335 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  26.93 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  26.09 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  25.89 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  25.23 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  24.39 
 
 
339 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  23.08 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  24.7 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  25.55 
 
 
339 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  22.87 
 
 
351 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  23.46 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  23.48 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  25.49 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  25.84 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  22.29 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  23.35 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  22.55 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  24.25 
 
 
349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  23.35 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  22.09 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  26.79 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  23.35 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  24.1 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  23.35 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  23.21 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  23.71 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  23.28 
 
 
337 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  24.85 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  23.21 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  23.21 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  24.55 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  22.05 
 
 
333 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  24.55 
 
 
338 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  23.15 
 
 
330 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  25.99 
 
 
336 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  24.46 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  22.81 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  23.48 
 
 
339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  24.15 
 
 
338 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  26.38 
 
 
336 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  23.67 
 
 
351 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  25.23 
 
 
343 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  23.48 
 
 
339 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  22.29 
 
 
343 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  22.92 
 
 
336 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  22.92 
 
 
348 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  23.17 
 
 
339 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  22.92 
 
 
336 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  23.49 
 
 
349 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  23.97 
 
 
335 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  25.87 
 
 
337 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>