252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02888 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
346 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  89.02 
 
 
351 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  84.31 
 
 
351 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  76.63 
 
 
348 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  75 
 
 
350 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  75.75 
 
 
349 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  76.04 
 
 
348 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  76.04 
 
 
348 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  76.04 
 
 
348 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  75 
 
 
350 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  75 
 
 
350 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  77.13 
 
 
345 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  75 
 
 
350 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  75.76 
 
 
348 aa  524  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  75.15 
 
 
347 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  75.44 
 
 
348 aa  518  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  75.75 
 
 
351 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  77.11 
 
 
349 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  74.78 
 
 
349 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  70.09 
 
 
350 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  69.46 
 
 
351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  69.44 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  69.97 
 
 
351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  57.83 
 
 
339 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  58.01 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  58.31 
 
 
338 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  57.7 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  57.83 
 
 
333 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  57.53 
 
 
338 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  55.89 
 
 
339 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  55.89 
 
 
339 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  55.89 
 
 
339 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  54.98 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  56.75 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  55.59 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  55.86 
 
 
347 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  57.54 
 
 
346 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  52.57 
 
 
334 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  50.3 
 
 
337 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  51.67 
 
 
334 aa  352  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  50.15 
 
 
336 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  50.15 
 
 
336 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  48.93 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  50.72 
 
 
346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  48.78 
 
 
333 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  49.39 
 
 
334 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  48.75 
 
 
329 aa  333  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  48.48 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  44.07 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  44.07 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  49.38 
 
 
333 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  45.35 
 
 
333 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  45 
 
 
330 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  42.68 
 
 
331 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  44.51 
 
 
331 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  43.6 
 
 
331 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  45.73 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  43.93 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  43.29 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  44.55 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  43.93 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  44.55 
 
 
331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  45.73 
 
 
331 aa  305  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  45.57 
 
 
332 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  44.38 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  45.51 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  44.38 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  45.43 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  47.09 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 
332 aa  299  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  44.48 
 
 
337 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  43.9 
 
 
331 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  44.95 
 
 
331 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  44.04 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  43.21 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24220  flagellar motor switch protein  42.81 
 
 
331 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  43.52 
 
 
330 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  43.52 
 
 
330 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  41.95 
 
 
340 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  41.95 
 
 
340 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  43.21 
 
 
330 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  43.21 
 
 
330 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  43.21 
 
 
330 aa  279  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  43.21 
 
 
330 aa  278  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1709  flagellar motor switch protein FliG  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.311791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2172  flagellar motor switch protein G  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.450504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1245  flagellar motor switch protein G  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2039  flagellar motor switch protein G  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1703  flagellar motor switch protein G  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0342564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2715  flagellar motor switch protein G  42.81 
 
 
331 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>