252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1959 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
333 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  99.1 
 
 
338 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  94.28 
 
 
339 aa  627  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  90.99 
 
 
339 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  89.79 
 
 
339 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  89.79 
 
 
339 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  88.89 
 
 
339 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  88.89 
 
 
338 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  88.59 
 
 
338 aa  603  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  89.39 
 
 
338 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  72.04 
 
 
347 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  70.09 
 
 
337 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  70.3 
 
 
346 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  65.86 
 
 
338 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  58.48 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  59.57 
 
 
336 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  59.57 
 
 
336 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  59.04 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  57.59 
 
 
346 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  57.89 
 
 
351 aa  391  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  58.2 
 
 
345 aa  391  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  58.2 
 
 
350 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  57.23 
 
 
334 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  56.93 
 
 
351 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  56.92 
 
 
348 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  58.2 
 
 
350 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  56.63 
 
 
351 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  57.81 
 
 
349 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  58.2 
 
 
350 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  56.33 
 
 
350 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  58.2 
 
 
350 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  56.53 
 
 
347 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  56.33 
 
 
349 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  57.59 
 
 
348 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  57.28 
 
 
348 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  57.28 
 
 
348 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  54.08 
 
 
334 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  57.81 
 
 
351 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  57.28 
 
 
348 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  57.28 
 
 
348 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  56.02 
 
 
338 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  56.88 
 
 
349 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  57.72 
 
 
333 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  52.68 
 
 
329 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  52.15 
 
 
334 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  51.09 
 
 
331 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  51.53 
 
 
329 aa  358  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  51.53 
 
 
329 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  53.15 
 
 
346 aa  353  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  51.4 
 
 
331 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  52.66 
 
 
331 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  52.04 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  52.35 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  52.35 
 
 
331 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  52.35 
 
 
331 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  52.16 
 
 
333 aa  345  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  51.4 
 
 
331 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  51.4 
 
 
331 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  51.41 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  51.41 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  51.41 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  51.41 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  51.41 
 
 
331 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  51.72 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  51.72 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  52.04 
 
 
331 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  50.78 
 
 
331 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  50.78 
 
 
331 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  49.25 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  49.08 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  50.46 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  47.85 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  48.29 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  47.85 
 
 
332 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  48.3 
 
 
331 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  47.99 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  47.35 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  47.35 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  48.92 
 
 
331 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  47.06 
 
 
331 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  48.89 
 
 
331 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
330 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
330 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
330 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  45.99 
 
 
330 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  44.98 
 
 
340 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  46.63 
 
 
331 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  44.98 
 
 
340 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  46.13 
 
 
330 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1890  flagellar motor switch protein G  45.82 
 
 
330 aa  295  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  44.58 
 
 
330 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  44.89 
 
 
330 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  45 
 
 
337 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 
339 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2128  flagellar motor switch protein G  43.87 
 
 
331 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  43.87 
 
 
331 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1272  flagellar motor switch protein G  43.87 
 
 
331 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.674292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  43.87 
 
 
331 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  43.87 
 
 
331 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.296587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  44 
 
 
333 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>