242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3216 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
345 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  73.33 
 
 
359 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  73.33 
 
 
359 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  74.55 
 
 
358 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  61.52 
 
 
342 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  58.43 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  54.07 
 
 
344 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  54.03 
 
 
344 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  33.73 
 
 
340 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  34.13 
 
 
362 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  33.23 
 
 
339 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  34.59 
 
 
362 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  34.47 
 
 
362 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  34.78 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  33.85 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  33.72 
 
 
363 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  33.72 
 
 
362 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  33.54 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  34.3 
 
 
336 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  34.29 
 
 
351 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  33.77 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  33.77 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  32.76 
 
 
350 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  31.72 
 
 
339 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0342  flagellar motor switch protein G  35.61 
 
 
346 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320445  normal  0.0115185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0310  flagellar motor switch protein G  35.61 
 
 
346 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0722  flagellar motor switch protein G  33.73 
 
 
347 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  32.69 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  31.75 
 
 
350 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4221  flagellar motor switch protein G  34.7 
 
 
351 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  31.75 
 
 
350 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0247  flagellar motor switch protein G  32.09 
 
 
345 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0377031  normal  0.550759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0306  flagellar motor switch protein G  34.57 
 
 
335 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0113  flagellar motor switch protein G  33.69 
 
 
351 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1152  flagellar motor switch protein G  31.5 
 
 
362 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  28.74 
 
 
330 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  28.82 
 
 
330 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  28.78 
 
 
338 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  27.68 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  27.06 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  27.68 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  30.56 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  27.63 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  27.63 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  26.65 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  27.74 
 
 
336 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  27.78 
 
 
336 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  28.74 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  26.47 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  25.85 
 
 
335 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  26.95 
 
 
338 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  25.94 
 
 
337 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  25.85 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1660  flagellar motor switch protein FliG  22.39 
 
 
340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  26.91 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  26.63 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  25.07 
 
 
349 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  28.04 
 
 
331 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  25.45 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  29.09 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  26.22 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  24.16 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  24.53 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  26.07 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  23.81 
 
 
338 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  27.27 
 
 
338 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  24.79 
 
 
347 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  24.01 
 
 
334 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  23.62 
 
 
332 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  26.24 
 
 
360 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  24.12 
 
 
338 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  24.93 
 
 
339 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  23.74 
 
 
335 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  24.62 
 
 
346 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  23.55 
 
 
346 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  25.29 
 
 
343 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
344 aa  103  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  25.53 
 
 
337 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  24.85 
 
 
336 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  25.98 
 
 
336 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  24.55 
 
 
339 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  24.55 
 
 
339 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  23.95 
 
 
339 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  26.95 
 
 
333 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  22.43 
 
 
329 aa  99.4  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  22.58 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  24.62 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  23.95 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  24.55 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  24.7 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  24.1 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  23.93 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  25.38 
 
 
331 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  22.35 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  25.38 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  24.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>